Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP17L12C9JPN9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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USP17L12C9JPN9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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USP17L12C9JPN9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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USP17L12C9JPN9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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USP17L12C9JPN9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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