Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms