Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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HECTD4Q9Y4D8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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HECTD4Q9Y4D8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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HECTD4Q9Y4D8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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HECTD4Q9Y4D8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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HECTD4Q9Y4D8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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