Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF8Q9UPP1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms