Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms