Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3GL2Q99962 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL2Q99962 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms