Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms