Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms