Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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