Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHC2Q5JST6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms