Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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