Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7AQ04656 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms