Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms