Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms