Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 OR4C15-201ENST00000314644 1113 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 OR5D14-201ENST00000335605 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MRPS31P5-202ENST00000423686 920 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC01468-202ENST00000435813 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC244093.4-201ENST00000620689 710 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FAM153A-202ENST00000393518 1138 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RPL12P2-201ENST00000424565 493 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC008268.1-201ENST00000425887 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 KCNMB2-207ENST00000452583 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms