Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms