Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms