Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms