Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NKD1Q969G9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms