Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

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Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEIL3Q8TAT5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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