Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNS3Q68CZ2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms