Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRPF38BQ5VTL8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRPF38BQ5VTL8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms