Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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