Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATMQ13315 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATMQ13315 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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