Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms