Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCAMP43121 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCAMP43121 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCAMP43121 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MCAMP43121 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCAMP43121 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms