Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTX3P26022 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms