Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DESP17661 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DESP17661 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DESP17661 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DESP17661 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DESP17661 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DESP17661 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DESP17661 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DESP17661 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms