Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP5A6NIR3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms