Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms