Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms