Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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