Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms