Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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SCN9AQ15858 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCN9AQ15858 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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