Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMB3Q13751 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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