Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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