Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms