Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMSP52788 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMSP52788 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMSP52788 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMSP52788 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMSP52788 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMSP52788 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMSP52788 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMSP52788 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMSP52788 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMSP52788 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms