Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms