Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms