Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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