Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEPDP12955 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEPDP12955 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms