Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms