Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms