Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms