Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMER1Q5JTC6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms