Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms