Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIRAP54198 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIRAP54198 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms