Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms