Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdfS4R2K0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdfS4R2K0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms